Enquanto eu usava a biblioteca HDF5 sem nenhum problema com o Ubuntu versão 16.04 LTS, depois que eu atualizei o Ubuntu para o Ubuntu 18.04 LTS, tive problemas em instalar o HDF5 com Intel Fortran e C Compilers.
Instalei com sucesso o HDF5 com gcc e gfortran.
Mas, eu preciso instalar o HDF5 com Intel Fortran e C Compilers para uso adicional de códigos de computação científica que são compatíveis apenas com os compiladores da Intel.
Eu instalei szip-2.1.1
e zlib-1.2.11
no caminho de $HOME/LIB
usando
com estas bandeiras no perfil bash
export CC=icc
export CXX=icpc
export FC=ifort
export F9X=ifort
export CFLAGS='-O3 -xHost -ip'
export CXXFLAGS='-O3 -xHost -ip'
export FCFLAGS='-O3 -xHost -ip'
e tentou instalar
hdf5-1.10.2
com a seguinte configuração
./configure --prefix=$HOME/LIB --with-zlib=$HOME/LIB --with-szip=$HOME/LIB LD_LIBRARY_PATH=-L/home/scyook/LIB/lib CPPFLAGS=-I/home/scyook/LIB/include --enable-fortran --enable-cxx --enable-fortran2003
No entanto, aparece a próxima mensagem de erro.
checking size of size_t... configure: error: in '/home/scyook/LIB/hdf5-1.10.2':
configure: error: cannot compute sizeof (size_t)
estas são as últimas partes do config.log
. #define SIZEOF_INT32_T 0
. #define SIZEOF_UINT32_T 0
. #define SIZEOF_INT_LEAST32_T 0
. #define SIZEOF_UINT_LEAST32_T 0
. #define SIZEOF_INT_FAST32_T 0
. #define SIZEOF_UINT_FAST32_T 0
. #define SIZEOF_INT64_T 0
. #define SIZEOF_UINT64_T 0
. #define SIZEOF_INT_LEAST64_T 0
. #define SIZEOF_UINT_LEAST64_T 0
. #define SIZEOF_INT_FAST64_T 0
. #define SIZEOF_UINT_FAST64_T 0
configure: exit 77
Posso obter ajuda para resolver este problema?