Eu encontrei um problema semelhante, especialmente quando você ainda está acessando o ponto de montagem. Pode abaixo de qualquer uma das duas razões abaixo.
Você não pode executar na raiz FS
Digamos que você pode no diretório "/ mnt" e você desmontou o volume montado em "/ mnt". Você encontrará o mesmo erro. Faça uso de que você não está no mesmo diretório.
Antes:
root@ip-172-31-28-38 /mnt# fsck -f /dev/xvdh
fsck from util-linux 2.23.2
e2fsck 1.42.12 (29-Aug-2014)
/dev/xvdh is in use.
e2fsck: Cannot continue, aborting.
root@ip-172-31-28-38 /mnt#
root@ip-172-31-28-38 /mnt# cd /
Depois:
root@ip-172-31-28-38 /# fsck -f /dev/xvdh
fsck from util-linux 2.23.2
e2fsck 1.42.12 (29-Aug-2014)
Pass 1: Checking inodes, blocks, and sizes
Pass 2: Checking directory structure
Pass 3: Checking directory connectivity
Pass 4: Checking reference counts
Pass 5: Checking group summary information
/dev/xvdh: 12/524288 files (0.0% non-contiguous), 70287/2097152 blocks
root@ip-172-31-28-38 /#