Esse idioma que indica a sobreposição é parte do shell do GNOME, então provavelmente não é tão fácil desativá-lo completamente.
Como solução alternativa, você pode definir outro atalho de teclado alternativo para alternar entre idiomas de entrada, por exemplo, Alt + Deslocamento , que não mostrará a sobreposição. Para fazer isso, siga as perguntas e respostas: O Ubuntu 17.10 não pode alterar o atalho de comutação de entrada para alt + shift .