Eu tenho o mesmo problema. Eu recentemente atualizei para o Ubuntu 18, e praticamente nenhuma GUI ou janela está funcionando. Aqui estão algumas informações:
$ gedit
gedit: symbol lookup error: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgtk-3.so.0:
undefined symbol: g_log_structured_standard$ gnome-system-monitor
gnome-system-monitor: symbol lookup error: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgiomm-2.4.so.1:
undefined symbol: g_application_set_option_context_description$ dpkg -l gnome-shell
ii gnome-shell 3.28.2-0ubuntu0.18.04.1$ lsb_release -a
Distributor ID: Ubuntu; Description: Ubuntu 18.04 LTS; Release: 18.04; Codename: bionic$ uname -a
Linux 4.15.0-23-generic #25-Ubuntu SMP x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux$ dpkg -s libgtk-3-0
Version: 3.22.30-1ubuntu1
Provides: gtk3-binver-3.0.0