Parece que o motivo é que o Ubuntu 18.04 mudou de volta para o Xorg como padrão e 17.10 tinha o Wayland como servidor de exibição padrão. Parece que o Xorg não suporta DPIs diferentes para telas diferentes e o Wayland faz isso.
Então a solução é: use o Wayland - você pode escolher na tela de login.
O Ubuntu 18.04 LTS substitui silenciosamente sua escolha pelo Xorg. Mesmo que Wayland funcione melhor na maioria dos casos.