Reinstale seu sistema em uma sessão ao vivo. Monte as partições sem formatá-las, o que preservará suas configurações e arquivos.
Lembre-se que é aconselhável criar um backup de seus arquivos pessoais da sessão ao vivo antes de fazer isso.
E pare de usar "rm" em combinação com "sudo" ou uma sessão raiz e avalie por que você sente a necessidade. Não deve haver um motivo para remover qualquer arquivo na base do sistema. Se você instalou o software no sistema básico, não faça isso (use / opt /) ou use a ferramenta correta para removê-los (como o apt purgar ou o apt remove).