Por padrão, o Nano salva no diretório de trabalho atual (CWD) ou no caminho relativo do seu CWD para o arquivo que está aberto. Se você quiser salvar em outro diretório, basta prefixar o nome do arquivo com o caminho
Por exemplo
Ctrl + O abre o aviso de salvar
File Name to Write: ~/test.txt
Salvar o test.txt no meu diretório pessoal
File Name to Write: ../test.txt
Salvará test.txt em um diretório acima do meu CWD
File Name to Write: /absolute/path/to/file/text.txt
Salvar o texto.txt no diretório /absolute/path/to/file/
Depois de salvar um arquivo, o nano estará usando esse caminho no buffer. Para ver que o caminho Ctrl + O abre o prompt de salvamento com o novo caminho relativo Ctrl + C para cancelar o salvamento
Enquanto no prompt salvar Ctrl + T abre um prático navegador de arquivos que você pode usar