Crie um arquivo em $HOME/.local/share/applications/audacity.desktop
com este conteúdo:
#!/usr/bin/env xdg-open
[Desktop Entry]
Version=1.0
Terminal=false
Type=Application
Name=Audacity
Exec=/usr/bin/flatpak run org.audacityteam.Audacity
Icon=__path_to_the_icon_on_your_filesystem__
Depois disso, o lançador aparecerá no painel: pressione super (windows), digite "audacity" e inicie o aplicativo. Enquanto o audacity está sendo executado, clique com o botão direito no ícone no dock e escolha "Add To Favorites".