De um modo geral, eu diria que você deve ficar com o DEB para a maioria dos aplicativos que dependem de bibliotecas do sistema. Isso tem a vantagem de que, se você atualizar essa biblioteca, por exemplo, por motivos de segurança, todos os aplicativos que usam essa biblioteca serão beneficiados, mesmo que o mantenedor do aplicativo original não tenha conhecimento da vulnerabilidade.
Os SNAPS são bons nos casos em que você está interessado em atualizar aplicativos específicos sem atualizar todo o sistema. Por exemplo. você está em uma versão LTS, mas quer ter a versão mais recente de um aplicativo específico. Em comparação com os PPAs em que os aplicativos precisam ser compilados em relação às "antigas" bibliotecas do sistema, em um piscar de olhos, os aplicativos trazem suas próprias bibliotecas. Isto é mais fácil para os mantenedores e pode evitar que você desembarque em dependência, caso você use muitos PPAs.