Também não sei como isso aconteceu, mas estou disposto a apostar que a configuração de fonte padrão foi alterada em algum momento durante o caminho. Eu verifiquei as configurações de Language & Appearance e notei Default (DejaVu Serif) foi selecionado, então eu mudei para Arial (com o mesmo tamanho de fonte) e tudo voltou para a forma como parecia antes da atualização.