Alguns fabricantes de unidades de inicialização instalam o Ubuntu como uma partição ISO 9660.
O Gparted não é muito bom em partições ISO 9660, no entanto, você pode tentar criar uma nova tabela de partições no USB usando o gparted. Você pode ter que acertar ignorar algumas vezes, em seguida, cancelar. Se houver um problema, você pode obter a partição ISO desmontada usando Discos.
Você também pode restaurar a unidade usando a função mkusb's "restaurar para um dispositivo de armazenamento padrão", esse método sempre funciona para mim.
Eu tive blocos flash com várias partições ao formatá-lo no Windows.