Acontece que este é o comportamento real pretendido do Nautilus. Não se lembra das configurações de visualização por pasta; é apenas uma configuração global em Arquivo > Preferências > seção Exibição padrão . Esta mudança provavelmente veio a partir do Nautilus 3.5.x, como apontado em @ Chriki 's answer .
No entanto, o gerenciador de arquivos do Nemo lembra as configurações de visualização de cada pasta, então acabei instalando-o.
Para instalar o lançamento estável do Nemo, digite o seguinte em um terminal:
sudo add-apt-repository ppa:gwendal-lebihan-dev/cinnamon-stable
sudo apt-get update
sudo apt-get install nemo
Fonte: Como instalar o gerenciador de arquivos Nemo no Ubuntu