O comando gxsudo thunar
que você tentou executar no Ubuntu MATE 16.04 está incorreto. O comando correto no Ubuntu MATE 16.04 é:
gksu thunar
O pacote gksu, que fornece front-ends GTK + para su (gksu) e sudo (gksudo), foi removido dos repositórios do Ubuntu 18.04 por razões de segurança, por isso não estará disponível a partir deste lançamento do Ubuntu.
Recomenda-se no Ubuntu 18.04 e posteriores que o thunar seja aberto como root somente quando necessário, caso contrário use cd
no terminal para alterar os diretórios.
sudo -H thunar &>/dev/null