Goto System -> Preferences -> Startup Applications.
ou
Dash -> Type: Startup Applications
A janela Preferências do aplicativo de inicialização é aberta. Em seguida, clique em Adicionar , dê um nome para o aplicativo no campo Nome ("Guake" é suficiente) e digite "guake" sem aspas no Comando e clique em Adicionar . Em seguida, feche a janela Startup Application Preferences e reinicie a máquina, agora o Guake deve iniciar automaticamente no login.