Ok, eu encontrei a solução. Foi apenas sobre mim e meu conhecimento faltando sobre Linux, LaTex e procurando os termos errados no google. Desculpe pela pergunta.
Alterei o caminho path/to/texlive/bin/ linux-i386 /pdflatex para path/to/texlive/bin/ x86_64-linux /pdflatex . Agora tudo funciona bem.
Obrigado por ajudar.