Não posso responder diretamente à sua pergunta, mas posso apontar você na direção certa. A ACPI provavelmente está envolvida. Um teste rápido seria inicializar sem ele adicionando acpi=off
à sua linha de kernel do grub.
Como faço para desativar a ACPI ao inicializar?
Por outro lado, talvez seja necessário ajustar um script da ACPI para fazer com que reboot
não faça realmente o equivalente shutdown -h now
Provavelmente também é um bom momento para aprender mais sobre a ACPI, é realmente muito legal. link