Para alterar a posição do terminal, execute primeiro
gnome-shell-extension-prefs
Deverá aparecer uma janela que lista todas as extensões de shell do GNOME instaladas. Clique no ícone de roda dentada (ou algo similar) ao lado da entrada "Terminal suspenso". Uma janela de preferências deve aparecer. Selecione " Direito " para Posição .
Talvez seja necessário fazer login novamente para ver a alteração.