Instalar o daemon de controle de ventilador ( macfanctld ) para o Macbook Pro resolveu o problema, a CPU agora não "entra em pânico" sobre o desempenho do ventilador que varia com a temperatura:
sudo apt-get install macfanctld
Foi uma solução rápida e simples, queria que alguém tivesse me dito mais cedo! Espero que isso ajude alguém que usa o macbook pro e se depara com o mesmo problema. Outra experiência foi que as versões LTS do Ubuntu têm essa funcionalidade já embutida nelas, então você corre para esse problema com menos frequência. Além disso, instalar o macfanctld nas versões LTS não faz mal; então eu recomendo strongmente usá-lo para qualquer um que esteja considerando instalar o ubuntu em um macbook!