Eu desabilitaria o daemon nvidia-persistenced. É realmente destinado a aplicativos de servidor de GPU usando CUDA, onde não há um servidor X em execução. Tudo o que ele faz é abrir o dispositivo da GPU e mantê-lo aberto. A GPU leva alguns segundos para inicializar, portanto, o daemon de persistência é útil para executar muitas tarefas CUDA de curta duração. Em uma máquina desktop, o servidor X irá manter o dispositivo GPU aberto, então o nvidia-persistence não terá nenhum benefício.
Dito isto, parece que você ainda pode estar tendo problemas gerais de driver da GPU. Eu não acho que machucaria tentar a versão 390.42 - parece haver um número de bugs recentemente, mas esperamos que a Nvidia esteja trabalhando para consertá-los.