Pelo que entendi (isso é resultado de uma pesquisa rápida), o ambiente Bash no Windows tem dois diretórios "home" separados: um contendo seus arquivos do Windows e o outro contendo arquivos como .bashrc e outro diretório home tradicional arquivos encontrados no Linux. Para navegar até o tipo de pasta do documento do Windows: cd /mnt/c/Users/yourusername/Documents/
. A partir daí, compile seu programa usando o gcc com gcc Hello.c -o Hello
.