Eu descobri que há uma configuração em /etc/phpldapadmin/config.php de auto_number ...
Eu defino: $servers->setValue('auto_number','enable',true); e $servers->setValue('auto_number','mechanism','search'); e $servers->setValue('auto_number','min',array('uidNumber'=>5000,'gidNumber'=>5000));
Eu poderia logar com su - e via shell gráfico.