Você não pode executar um software projetado para manipular o ambiente de trabalho Windows com o Ubuntu.
Se esse for um recurso exclusivo que você precisa, não deverá alternar para o Ubuntu.
No entanto, há muitas personalizações da área de trabalho do GNOME (padrão do Ubnutu) disponíveis (veja, por exemplo, GNOME-Look ), e, claro, há muitos sabores do Ubuntu que vêm com uma variedade de outros gerenciadores de desktop, cada um com uma aparência diferente.