Embora o seu problema não seja estritamente relevante para o Ubuntu, em resumo você pode ter um BCD do Windows bagunçado ou configurado incorretamente ou um arquivo bootmgfw.efi ausente / corrompido (se você tiver um disco GPT). De qualquer forma, você não poderá inicializar.
Você não mencionou se está usando um disco UEFI GPT ou um MBR (estou assumindo o primeiro caso). Basta dizer que você precisará inicializar externamente no 'modo de reparo' a partir de um DVD de instalação do Windows ou de um
O BIOS é independente do seu sistema operacional, ou seja, você deve conseguir acessar o BIOS e salvar as configurações mesmo sem um disco rígido em sua máquina. Primeiramente, se um HDD estiver instalado, ele deve ser detectado automaticamente pelo BIOS, quer tenha um sistema operacional ou não, bem como qualquer unidade externa, se estiver conectada. Primeiro, gostaria de verificar em seu BIOS se 'boot seguro' está ativado. Se for o caso, desabilite-o, pois isso pode fazer com que seu HDD desapareça inexplicavelmente às vezes; Isso acontece se o Windows 7 estiver instalado. Salve isso e, em seguida, entre novamente no BIOS. Se suas unidades ainda não forem detectadas, você poderá estar vendo problemas de hardware.
Demora muito para entrar nas maravilhas da configuração do BCD, mas leia Como corrigir o Windows 8 Problemas de UEFI . É o mesmo procedimento de reparo para um Win 10 BCD. Boa sorte!