A questão parece estar ligada a uma falta ou má interpretação da documentação. No meu arquivo, estou nomeando a tabela de partições " boot-root ":
d-i partman-auto/expert_recipe string \
boot-root :: \
Esse nome deve ser chamado ao escolher qual receita usar:
d-i partman-auto/choose_recipe select boot-root
Desta forma, o d-i saberá qual tabela de partições usar. Não há menção para isso na documentação:
# You can choose one of the three predefined partitioning recipes:
# - atomic: all files in one partition
# - home: separate /home partition
# - multi: separate /home, /var, and /tmp partitions
d-i partman-auto/choose_recipe select atomic
Isso foi confuso para mim, espero que essa resposta ajude alguém.