Se bem entendi, você copiou arquivos do seu laptop Win10 para um disco rígido externo. Estou assumindo que o seu disco rígido externo está em algum tipo de gabinete conectado por USB. Provavelmente seria útil conhecer o formato do sistema de arquivos do disco rígido externo, mas vou assumir que ele é NTFS.
Se tudo isso for verdade, você deve ser capaz de simplesmente conectar seu disco rígido externo ao seu desktop Ubuntu 16.04. O Ubuntu 16.04 deve ser pré-instalado com os componentes ntfs-3g necessários para ler o seu HDD NTFS. Então você deve ser capaz de simplesmente copiar os arquivos do disco rígido externo para o seu desktop Ubuntu 16.04 usando um método de arrastar e soltar ou possivelmente algo como o rsync.
Espero que isso ajude!
Alguns links que podem ajudar:
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