Tabela de partições
Se você está falando de um sistema Ubuntu live , sim, a tabela de partições MSDOS do MBR é recomendada, por exemplo, se você usar Rufus no Windows. Rufus é uma ferramenta de extração com boa reputação.
Se você está falando de um instalado Ubuntu sistema (como em uma unidade interna, mas, neste caso, em uma unidade USB), você pode selecionar a tabela de partições MSDOS do alias MBR e a tabela de partições GUID do alias GPT, mas será mais fácil com o MBR.
Clonando o sistema ISO 9660
Mas se você clonar de um arquivo iso do Ubuntu no USB pendrive, você não precisa se preocupar com o setor / método de inicialização, tudo será clonado e você terá um sistema 'híbrido' com um Sistema ISO 9660 que inclui o setor de inicialização 'automaticamente'. O método de clonagem é muito confiável e criará um sistema Ubuntu (live-only) ao vivo, que pode inicializar tanto no modo UEFI quanto no modo BIOS (modo legado CSM alias).
Ferramentas de clonagem no linux:
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Ubuntu 16.04 LTS e mais recente: Criador de disco de inicialização
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alias de discos gnome-disks
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mkusb (instale a partir de um PPA)
Ferramenta de clonagem no Windows: