O que você vê com ls é a entrada mask da ACL. A partir de man setfacl , a entrada mask parece refletir as permissões máximas possíveis que podem ser definidas em uma entrada da ACL.
the permissions of the mask entry are further adjusted to include the union of all permissions affected by the mask entry
Os direitos de acesso que você vê no seu exemplo com ls para o grupo padrão root:rwx estão errados, pois os direitos efetivos agora são controlados pelas ACLs.