Se você quiser limpar o banco de dados do dconf, você primeiro tem que descarregar toda a configuração do dconf via:
morfik:~$ cd ~/.config/dconf/
morfik:~/.config/dconf$ dconf dump / > user-backup
morfik:~/.config/dconf$ ls -al ./user-backup
-rw-r--r-- 1 morfik morfik 30.0K 2015-02-07 08:18:04 ./user-backup
morfik:~/.config/dconf$ rm user
Após essas etapas, você terá que reabrir sua sessão gráfica (sair / entrar). Isso criará o arquivo ~/.config/dconf/user
novamente com quase 0 conteúdo - configurações padrão.
Quanto ao arquivo user-backup
que você criou anteriormente, é apenas um arquivo de texto simples:
...
[apps/light-locker]
late-locking=false
lock-after-screensaver=uint32 1
lock-on-suspend=true
...
Você pode editá-lo e remover as entradas / blocos desejados desse arquivo. Em outras palavras - limpe-o.
Quando terminar, carregue-o:
morfik:~/.config/dconf$ dconf load / < ./user-backup
morfik:~/.config/dconf$ ls -al ./user-backup
-rw-r--r-- 1 morfik morfik 14.0K 2015-02-07 08:26:23 ./user-backup
morfik:~/.config/dconf$ dconf update /
Acho que você deve reiniciar sua sessão gráfica depois disso novamente.
E é isso, mas você precisa lembrar que todas as entradas que possuem valores padrão não serão salvas - elas serão criadas novamente quando algum aplicativo solicitar, o que é bom porque você deseja fazer backup apenas dos valores você tinha mudado.