SizeReporter é uma ferramenta que eu escrevi e que vem sem interface gráfica. O principal gatilho para criar essa ferramenta era ter uma maneira de executar um aplicativo de relatório de espaço em disco em um serviço e obter somente dados não processados. Processamento adicional e relatório / diagramação próprios podem ser feitos de forma personalizada usando outro Software. Fiquei surpreso que, no Windows, não consegui encontrar nada de graça que realmente atendesse às minhas necessidades.
A ferramenta não é realmente espetacular, mas pode lidar com muitas peculiaridades e problemas nos sistemas de arquivos (timestamps ruins, caminhos muito longos, junções, ...). "du" (sysinternals) foi a ferramenta que usei no passado, mas apresenta apenas um resumo.
Espero que isso também possa ser útil para os outros.
página de download SizeReporter