Esta resposta é antiga, mas parece continuar a receber tráfego. Conforme observado abaixo, há uma ferramenta incorporada no Windows agora:
Iniciar → Todos os Programas → Acessórios → Ferramentas do Sistema → Monitor de Recursos (ou Executar o resmon.exe)
Você pode obter mais informações nas respostas abaixo desta. O restante desta resposta não é mais tão relevante.
OProcess Explorer da Sysinternals permitirá que você pesquise pelas alças e DLLs. Procure o diretório e descubra qual processo está "usando" a pasta.
De lá, você pode encerrar esse processo ou apenas fechar esse identificador de arquivo específico. Certifique-se sobre o que você está fazendo ao trabalhar com o identificador de arquivo diretamente e verifique se ele não está sendo usado por algum processo importante.