A ordem dos argumentos da linha de comando é importante. Esta linha de comando deve funcionar, mas irá gerar um arquivo gigante:
ffmpeg -i yesbuddy.mov -pix_fmt rgb24 output.gif
Observe que você provavelmente deseja reduzir a taxa de quadros e o tamanho ao converter, além de especificar uma hora e duração de início. Você provavelmente não deseja converter o arquivo inteiro em sua resolução original e taxa de quadros.
ffmpeg -ss 00:00:00.000 -i yesbuddy.mov -pix_fmt rgb24 -r 10 -s 320x240 -t 00:00:10.000 output.gif
O tamanho do arquivo ainda será enorme. Você pode usar o otimizador de GIF do ImageMagick para reduzir o tamanho:
convert -layers Optimize output.gif output_optimized.gif