O problema é que o cliente RDP se lembra da resolução da sua última conexão.
Isso pode ser solucionado ajustando a resolução na caixa de diálogo de conexão RDP para "Tela inteira"
Options >> Display > Remote Desktop Size: Full Screen (to the right)
Outra possibilidade é criar um atalho na área de trabalho para cada uma das suas resoluções mais usadas. Isso pode ser feito fazendo um atalho para o RDP e adicionando os seguintes sinalizadores:
/w:[width] and /h:[height]
Exemplos de atalhos seriam então:
Docked: %SystemRoot%\system32\mstsc.exe /w:1600 /h:1200
Laptop: %SystemRoot%\system32\mstsc.exe /w:1920 /h:1200