Eu não tenho números específicos, mas haverá uma queda no desempenho, ainda que leve.
Houve uma postagem no blog que descreveu o desempenho geral da criptografia de disco completa em uma partição do sistema e como isso pode afetar o desempenho percebido pelos usuários. Parece indicar que a CPU tem um desempenho maior do que o disco rígido:
For me the critical question was what kind of overhead does encrypting your hard drive have on the performance of the system as a whole. To try and measure this I used HDTune to measure drive performance before and after encryption with TrueCrypt. Before encryption I saw an average transfer rate of about 47MB/s with my laptop's SATA drive in AHCI mode. Max was about 59.9MB/s and a burst rate of 85.8MB/s with an average CPU usage of 4.1% throughout the test.HD Performance before Truecrypt
After encryption I saw an average transfer rate of 46.9MB/s, peak of 59.7 MB/s, burst of 62.9MB/s and an average CPU usage of 26.7%. I didn't expect it, but that's where I saw my hit. It makes sense when you think about it - the encryption/decryption of the data generally doesn't result in reading/writing significantly more data (encryption and decryption is done at the block or sector level not at the entire file level) so you don't see substantially reduced disk performance.
O Tom's Hardware também tem um bom artigo, " Proteja seus dados com criptografia " , que detalha as implicações de desempenho do uso do TrueCrypt em um volume completo.
Além disso, veja a postagem no blog de Scott Gu sobre a velocidade do disco rígido físico (ou seja, o RPM) ( Dica / Truque: Velocidade do disco rígido e desempenho do Visual Studio ) que podem fazer uma grande diferença para Desempenho do Visual Studio se a criptografia é empregada ou não.
Há outro post aqui: Qual é o impacto no desempenho da criptografia do sistema com TrueCrypt