Você pode usar este utilitário: Relativo .
Basicamente cria um atalho para "explorer.exe" com o parâmetro do seu caminho relativo com um clique direito (da mesma maneira que você cria um atalho normal).
Claro que você pode fazer isso manualmente.
No seu exemplo, você criaria um atalho em "Novos Arquivos \ Ferramentas" para
%windir%\explorer.exe "..\..\Tested Files\Tools"
Você pode usar o menu de contexto usual "Novo / Criar atalho" do Windows para isso e digitar o comando acima na caixa "Digite a localização do item".