Como @ mikez302 disse em um comentário acima, execute como administrador . Em seguida, faça o seu estilo mudar via Configurações / Configurador de Estilo. Não há necessidade de editar esses arquivos manualmente.
A partir da v5.8.6, os arquivos de tema são armazenados em %PROGRAMFILES(x86)%
. O Vista / Win7 se recusará a gravar neste diretório quando o aplicativo não for executado como Administrador. Além disso, parece que as configurações de "Anulação Global" são salvas no arquivo de tema ativo. Espero que futuras versões do Notepad ++ armazenem essas configurações de tema específicas do usuário em %APPDATA%
como o paradigma do Windows pretende.