Para ativar o daemon atrun necessário, como man atrun diz, execute:
launchctl load -w /System/Library/LaunchDaemons/com.apple.atrun.plist
como raiz (por exemplo, via sudo ). Depois de fazer isso, /var/at/ será o diretório principal (embora a maneira mais simples seja usar at como raiz - por exemplo, mais uma vez, por sudo ! -).