Há uma opção nas configurações do Foxit Reader que permite que várias instâncias do programa sejam abertas.
Vá para Ferramentas- > Preferências- > Documentos- > Permitir várias instâncias
No entanto, no Foxit Reader versão 7.2.2: vá em Editar- > Preferências- > Documentos- > Permitir várias instâncias.
Isso abrirá um único arquivo em várias janelas, não em várias guias. Em seguida, organize as janelas vertical ou horizontalmente para visualizar dois arquivos simultaneamente. No entanto, não encontrei o comando de janela dividida como o Adobe Reader no Foxit.