Uma boa referência para isso é Battery University . Eles também têm um gráfico útil que compara cada tipo de bateria e como tratá-la.
Basicamente, existem duas maneiras de tratar uma bateria, dependendo do tipo.
Se for Lithium-Ion, não importa muito como você o carrega. Ele lida muito bem com carga e descarga superficiais e nunca desenvolve memória. A única desvantagem das descargas superficiais é que o medidor de carga pode se tornar impreciso (sem afetar a vida real da bateria), mas uma descarga completa seguida por uma carga completa irá recalibrá-lo. A descarga total da bateria regularmente pode ser mais prejudicial para ela.
Se a bateria for Ni-Cad ou NiMH, então ela preferirá estar totalmente descarregada e depois totalmente carregada. Se a bateria não estiver totalmente carregada ou descarregada, ela poderá desenvolver memória e ter menos capacidade.