Eu só tenho respostas para as últimas 3 perguntas (não tenho experiência profissional com a inicialização de drives flash).
Alguém mencionou que há preocupações sobre ciclos de gravação em flash drives. Ouvi dizer que está em algum lugar na área de 100.000 gravações e 500.000 gravações. É provavelmente o último. O problema com o uso do ext4 ou ext3 é que eles estão registrando sistemas de arquivos em diário. Isso significa que os dados são transferidos para o dispositivo de armazenamento, armazenados lá e, em seguida, gravados no local adequado no dispositivo de armazenamento. Dessa forma, se a gravação completa estiver incompleta e o computador travar, o dispositivo de armazenamento terá uma cópia e poderá continuar gravando. Isso reduzirá a vida útil do seu flash drive, especificamente, qualquer parte que esteja sendo usada como diário. Eu recomendaria usar um sistema de arquivos sem journaling para este propósito, como o ext2.
Eu não tive um drive USB corrompido. O limite de gravação que mencionei acima foi por unidade de memória. Com isso dito, eles constroem em unidades de memória de backup para serem usadas quando alguém morre. Além disso, até mesmo a estimativa mais baixa que ouvi, 100.000 gravações, vai demorar um pouco para chegar. Se você escrevesse para 1 unidade de memória 8 vezes por dia todos os dias, levaria mais de 30 anos para matar uma unidade de memória. Com isso dito, às vezes as instalações Live-USB usarão uma porção do pendrive USB como memória se o sistema não tiver memória RAM suficiente ou se não tiver certeza da quantidade de memória que terá acesso posteriormente, embora isso seja quase sempre acabou de fazer com Live-CDs para simular salvar dados, como o histórico do navegador da web. Como este é um Live-USB, ele pode salvar esses dados permanentemente. Com tudo isso dito, lembre-se de que uma unidade de memória não é um único byte, mas algum número de bytes que é determinado quando a unidade flash foi projetada.
Eu mesmo tive problemas para particionar um drive USB, mas é possível.
CORREÇÃO: Na segunda parte eu me refiro a um processo pelo qual uma unidade flash usa-se para RAM e, em seguida, se refere a algo semelhante para Live-CDs. Para Live-CDs, eles usam o que é chamado de RAMdrive, onde usam a RAM do sistema como um disco rígido virtual para "salvar" arquivos como o histórico do navegador. O que eu descrevi para drives flash pode não existir. Pode ter sido um pouco de confusão da minha parte (eu estou na faculdade e não estou totalmente acordado ainda), onde eu estava pensando em readyboost do Vista. Desculpe pela má informação.