é possível criar facilmente novos manipuladores de protocolo no Gnome, tudo que você precisa fazer é adicionar algumas chaves no gconf.
Em um terminal, digite:
gconftool-2 -s /desktop/gnome/url-handlers/foo/command '/path/to/app %s' --type String
gconftool-2 -s /desktop/gnome/url-handlers/foo/enabled --type Boolean true
Substitua foo em ambas as linhas pelo protocolo que você deseja registrar e / path / to / app pelo caminho para o aplicativo que você deseja executar. (de: link )