Acho que posso ter sua solução. Eu estava tendo o mesmo problema e foi assim que consertei. O problema que tive não foi com o Chrome, mas com o Windows 7. O navegador não estava abrindo completo devido a uma configuração de "preenchimento" do Windows. (isso me lembrou de um problema de CSS)
Tente isso ... Eu uso um tweaker chamado "ultimate windows tweaker" encontrado aqui link para exemplos e DL
Mas você pode alterar seu preenchimento aqui manualmente. Instruções
Como você muda, depende de você.
Agora, certifique-se de alterar o preenchimento para "0"
Quando isso for feito , você precisará refazer seus aplicativos .
Agora, tente ir para o GMAIL (ou qualquer outra coisa) e, em seguida, use as ferramentas, crie um atalho de aplicativo, aplique-o na área de trabalho. Quando estiver pronto, é o mesmo que antes ... Propriedades > EXECUTAR > Maximizado
Boa sorte, espero que isso resolva a questão. -Mike