Um pouco atrasado, mas espero que isso ainda possa ajudar alguém.
Eu tenho exatamente este mesmo problema, também no Windows 7 de 64 bits. Para mim, acabei de descobrir que foi causado pelo Outlook 2007.
Você pode descobrir qual aplicativo está mantendo um bloqueio na área de transferência executando o aplicativo de David Candy: link
Isso lhe dá o PID que tem o bloqueio.