Sim. Isso foi tratado por fsck em alguns lançamentos. Se a partição não estiver listada em /etc/fstab , provavelmente será necessário informar o tipo de partição. Eu usei isso de um CD do Linux para recuperar uma partição que o Windows não inicializaria.
Com base nos comentários abaixo, a correção real é feita pelo programa ntfsfix . Ele deve estar disponível, mesmo se não houver nenhum programa para executar um sistema de arquivos fsck on e NTFS.