O que você colou não é a saída padrão do comando (STDOUT), mas a saída de erro do comando (STDERR).
Quando você adiciona "> output_file" ao comando, você está apenas redirecionando STDOUT para esse arquivo, não para STDERR.
Se você deseja gerar erros, para o mesmo arquivo que a saída padrão você precisa usar
sbt clean test > log.log 2>&1
O que "2 > & 1" significa, é o erro de saída para o mesmo local que os resultados de saída padrão.
Você também pode fazer algo assim:
sbt clean test > log.log 2>error.log
Ele emitirá STDOUT para log.log e STDERR para o segundo arquivo chamado error.log, se você quiser separá-los.
Veja isto sobre os operadores de redirecionamento de comandos
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