Se você quiser mover o conteúdo de um diretório de origem e todos os seus subdiretórios para um diretório de destino único > (isto é, achatar a estrutura de pastas), é muito fácil e você nem precisa se preocupar com a linha de comando.
Basta ir para a pasta de origem de nível superior (cujo conteúdo você deseja copiar) e, na caixa de pesquisa do Windows Explorer, digite * (apenas uma estrela ou asterisco). Isso exibirá todos os arquivos e subpastas na pasta de origem. Agora, basta classificar por Tipo para agrupar todos os arquivos, selecioná-los todos e recortar / copiar e colar no diretório de destino.
Se você também tiver arquivos ocultos e de sistema, em Organizar → Opções de pasta e pesquisa → guia Exibir, verifique se Mostrar arquivos ocultos ... está selecionado e Ocultar arquivos protegidos do sistema operacional está desmarcada.