Se você quiser um rm personalizado, não o chame de rm , mas um nome seu, myrm , delete ou qualquer outra coisa.
O alias rm='rm -i' é um horror porque depois de um tempo, você espera que rm avise por padrão antes de remover os arquivos. Claro, um dia você vai executá-lo com uma conta que não tenha esse alias definido e antes de entender o que está acontecendo, já é tarde demais.
Em qualquer caso, uma boa maneira de estar preparado para a perda ou corrupção de arquivos é fazer backups.
Uma alternativa rápida que irá protegê-lo contra a exclusão ou substituição acidental de arquivos é usar um sistema de arquivos que suporte instantâneos ilimitados como o ZFS. Se os instantâneos frequentes forem feitos automaticamente, você poderá recuperar os arquivos no estado em que estavam durante o último instantâneo antes do incidente.