Basta adicionar a seguinte entrada dword no registro, conforme este link descreve:
Localização do registro do Windows:
Software\Policies\Google\Chrome\IncognitoModeAvailability
Compatível com:
Google Chrome (Linux, Mac, Windows) since version 14
Google Chrome OS (Google Chrome OS) since version 0.14
Descrição:
Specifies whether the user may open pages in Incognito mode in Google Chrome. If 'Enabled' is selected, pages may be opened in Incognito mode. If 'Disabled' is selected, pages may not be opened in Incognito mode. If 'Forced' is selected, pages may be opened ONLY in Incognito mode.
0 = Incognito mode available.
1 = Incognito mode disabled.
2 = Incognito mode forced.
Se este for um sistema de trabalho, a criação e manutenção desta chave (e por sua vez a disponibilidade da opção) podem estar sob o controle do seu administrador de rede.