Só posso responder com as informações disponíveis nos diferentes sites btrfs relacionados. Como você disse, o uso da compactação é relativamente seguro, pois a compactação é aplicada apenas ao novo conteúdo escrito. De acordo com a estabilidade do FS, ele ainda está em fase de testes, embora pareça bastante estável no momento. Sobre recomprimir todo o disco, não tenho certeza se você pode fazer isso (eu não o vi). Não deve ser difícil escrever tal ferramenta. No momento, a maneira óbvia é copiar / mover os dados da partição para outro disco / partição e, em seguida, copiar novamente, mas isso implica ter espaço suficiente em outro disco ou partição para fazer a cópia (e um bom tempo) ...