Você pode copiar os itens prefs.js relevantes manualmente.
-
mail.account.* -
mail.accountmanager.* -
mail.identity.* -
mail.server.* -
mail.smtpserver.* -
mail.smtpservers
Por exemplo:
egrep 'user_pref\("mail\.(account(manager)?|identity|(smtp)?servers?)[."]' \
< old-profile/prefs.js >> new-profile/prefs.js
O arquivo está localizado em seu diretório de perfil do Thunderbird, usa o mesmo formato em todas as plataformas, e até mesmo em todos os Thunderbirds versões (não mudou muito dos dias do Netscape Navigator, eu acredito).