De :help autocmd
:
If you want to skip autocommands for one command, use the :noautocmd command
modifier or the 'eventignore' option.
De :help :noautocmd
:
To disable autocommands for just one command use the ":noautocmd" command
modifier. This will set 'eventignore' to "all" for the duration of the
following command. Example:
:noautocmd w fname.gz
This will write the file without triggering the autocommands defined by the
gzip plugin.
Então parece que :noautocmd
é o que você está procurando.
Em que contexto você deseja desabilitar um augroup
?